Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC8A3P57103 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC8A3P57103 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC8A3P57103 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A3P57103 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC8A3P57103 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms