Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GSCP56915 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GSCP56915 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSCP56915 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GSCP56915 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GSCP56915 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSCP56915 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GSCP56915 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GSCP56915 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSCP56915 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSCP56915 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSCP56915 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSCP56915 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSCP56915 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSCP56915 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSCP56915 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSCP56915 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSCP56915 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSCP56915 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSCP56915 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSCP56915 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSCP56915 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSCP56915 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GSCP56915 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSCP56915 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSCP56915 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSCP56915 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSCP56915 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSCP56915 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSCP56915 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSCP56915 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSCP56915 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSCP56915 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSCP56915 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSCP56915 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSCP56915 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSCP56915 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSCP56915 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSCP56915 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSCP56915 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSCP56915 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GSCP56915 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSCP56915 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSCP56915 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSCP56915 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GSCP56915 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GSCP56915 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
GSCP56915 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GSCP56915 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSCP56915 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSCP56915 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSCP56915 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSCP56915 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSCP56915 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSCP56915 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GSCP56915 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSCP56915 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSCP56915 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSCP56915 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSCP56915 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSCP56915 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSCP56915 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSCP56915 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSCP56915 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSCP56915 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSCP56915 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GSCP56915 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSCP56915 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSCP56915 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSCP56915 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSCP56915 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSCP56915 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSCP56915 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSCP56915 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GSCP56915 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GSCP56915 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GSCP56915 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSCP56915 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSCP56915 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSCP56915 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSCP56915 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSCP56915 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSCP56915 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSCP56915 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSCP56915 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSCP56915 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSCP56915 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSCP56915 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSCP56915 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSCP56915 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSCP56915 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSCP56915 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSCP56915 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSCP56915 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSCP56915 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSCP56915 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSCP56915 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSCP56915 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSCP56915 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSCP56915 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.9 ms