Protein–RNA interactions for Protein: P51511

MMP15, Matrix metalloproteinase-15, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP15P51511 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP15P51511 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP15P51511 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP15P51511 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP15P51511 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP15P51511 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP15P51511 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP15P51511 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP15P51511 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP15P51511 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP15P51511 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP15P51511 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP15P51511 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP15P51511 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP15P51511 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP15P51511 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP15P51511 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP15P51511 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP15P51511 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP15P51511 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP15P51511 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP15P51511 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP15P51511 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP15P51511 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP15P51511 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP15P51511 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP15P51511 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP15P51511 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP15P51511 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP15P51511 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP15P51511 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP15P51511 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP15P51511 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP15P51511 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP15P51511 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP15P51511 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP15P51511 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP15P51511 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP15P51511 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP15P51511 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP15P51511 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP15P51511 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP15P51511 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP15P51511 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP15P51511 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP15P51511 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP15P51511 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP15P51511 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP15P51511 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP15P51511 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP15P51511 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP15P51511 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP15P51511 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP15P51511 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP15P51511 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP15P51511 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP15P51511 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP15P51511 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP15P51511 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP15P51511 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP15P51511 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP15P51511 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP15P51511 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP15P51511 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP15P51511 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP15P51511 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP15P51511 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP15P51511 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP15P51511 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP15P51511 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP15P51511 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP15P51511 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP15P51511 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP15P51511 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP15P51511 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP15P51511 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP15P51511 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP15P51511 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP15P51511 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP15P51511 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP15P51511 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP15P51511 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP15P51511 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP15P51511 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP15P51511 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP15P51511 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP15P51511 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP15P51511 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP15P51511 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP15P51511 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP15P51511 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP15P51511 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP15P51511 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP15P51511 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP15P51511 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP15P51511 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP15P51511 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP15P51511 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP15P51511 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP15P51511 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms