Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK9P50750 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK9P50750 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK9P50750 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK9P50750 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK9P50750 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK9P50750 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK9P50750 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK9P50750 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK9P50750 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK9P50750 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK9P50750 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK9P50750 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK9P50750 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK9P50750 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK9P50750 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK9P50750 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK9P50750 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK9P50750 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK9P50750 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK9P50750 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK9P50750 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK9P50750 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK9P50750 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK9P50750 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK9P50750 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK9P50750 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK9P50750 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK9P50750 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK9P50750 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK9P50750 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK9P50750 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK9P50750 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK9P50750 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK9P50750 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK9P50750 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK9P50750 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK9P50750 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK9P50750 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK9P50750 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK9P50750 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK9P50750 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK9P50750 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK9P50750 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK9P50750 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK9P50750 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK9P50750 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK9P50750 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK9P50750 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK9P50750 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK9P50750 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK9P50750 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK9P50750 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK9P50750 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK9P50750 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK9P50750 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK9P50750 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK9P50750 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK9P50750 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK9P50750 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK9P50750 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK9P50750 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK9P50750 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK9P50750 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK9P50750 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK9P50750 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK9P50750 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK9P50750 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK9P50750 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK9P50750 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK9P50750 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK9P50750 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK9P50750 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK9P50750 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK9P50750 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK9P50750 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK9P50750 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK9P50750 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK9P50750 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK9P50750 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK9P50750 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK9P50750 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK9P50750 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK9P50750 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK9P50750 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK9P50750 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK9P50750 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK9P50750 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK9P50750 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK9P50750 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK9P50750 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK9P50750 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK9P50750 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK9P50750 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK9P50750 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK9P50750 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK9P50750 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK9P50750 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK9P50750 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK9P50750 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms