Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK1A1P48729 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK1A1P48729 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1A1P48729 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1A1P48729 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSNK1A1P48729 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK1A1P48729 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms