Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX3P48380 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX3P48380 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX3P48380 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX3P48380 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX3P48380 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX3P48380 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX3P48380 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX3P48380 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX3P48380 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX3P48380 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX3P48380 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX3P48380 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX3P48380 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX3P48380 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX3P48380 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX3P48380 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX3P48380 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX3P48380 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX3P48380 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX3P48380 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX3P48380 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX3P48380 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX3P48380 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX3P48380 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX3P48380 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX3P48380 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX3P48380 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX3P48380 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX3P48380 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX3P48380 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX3P48380 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX3P48380 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX3P48380 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX3P48380 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX3P48380 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX3P48380 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX3P48380 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX3P48380 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX3P48380 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX3P48380 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX3P48380 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX3P48380 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX3P48380 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX3P48380 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX3P48380 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX3P48380 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX3P48380 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX3P48380 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX3P48380 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX3P48380 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX3P48380 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX3P48380 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX3P48380 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX3P48380 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX3P48380 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX3P48380 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX3P48380 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX3P48380 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX3P48380 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX3P48380 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX3P48380 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX3P48380 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX3P48380 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX3P48380 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX3P48380 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX3P48380 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX3P48380 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX3P48380 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX3P48380 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX3P48380 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX3P48380 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX3P48380 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX3P48380 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX3P48380 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX3P48380 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX3P48380 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX3P48380 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX3P48380 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX3P48380 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX3P48380 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX3P48380 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX3P48380 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX3P48380 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX3P48380 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX3P48380 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX3P48380 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX3P48380 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX3P48380 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX3P48380 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX3P48380 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX3P48380 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX3P48380 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX3P48380 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX3P48380 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX3P48380 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX3P48380 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX3P48380 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX3P48380 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX3P48380 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms