Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA2P47869 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA2P47869 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA2P47869 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA2P47869 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA2P47869 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA2P47869 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA2P47869 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA2P47869 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA2P47869 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms