Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRPPRCP42704 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRPPRCP42704 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRPPRCP42704 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRPPRCP42704 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
LRPPRCP42704 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
LRPPRCP42704 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LRPPRCP42704 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRPPRCP42704 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRPPRCP42704 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRPPRCP42704 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRPPRCP42704 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRPPRCP42704 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRPPRCP42704 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRPPRCP42704 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRPPRCP42704 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRPPRCP42704 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
LRPPRCP42704 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRPPRCP42704 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRPPRCP42704 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRPPRCP42704 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRPPRCP42704 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRPPRCP42704 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LRPPRCP42704 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRPPRCP42704 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRPPRCP42704 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRPPRCP42704 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRPPRCP42704 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms