Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CEACAM3P40198 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEACAM3P40198 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM3P40198 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM3P40198 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms