Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 BCL6-210ENST00000496823 1138 ntTSL 314.95□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 BCL6-209ENST00000480458 342 ntTSL 58.85□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 BCL6-207ENST00000470319 526 ntTSL 44.22□□□□□ -1.731e-8■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 PRPF3-207ENST00000496202 1082 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.754e-16■■■■■ 65
GTF2F1P35269 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 64.9
GTF2F1P35269 PPP1R3E-206ENST00000560913 932 ntTSL 219.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 64.6
GTF2F1P35269 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 64.6
GTF2F1P35269 PPP1R3E-209ENST00000561437 690 ntTSL 218.11■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 64.6
GTF2F1P35269 PPP1R3E-203ENST00000559314 2351 ntTSL 215.68■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 64.6
GTF2F1P35269 PPP1R3E-202ENST00000558058 3222 ntTSL 312.49□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 64.6
GTF2F1P35269 PPP1R3E-204ENST00000559942 1187 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 64.6
GTF2F1P35269 PPP1R3E-205ENST00000560073 444 ntTSL 54.81□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 64.6
GTF2F1P35269 LINC00482-202ENST00000577000 461 ntTSL 315.79■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 64.6
GTF2F1P35269 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.452e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.412e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.332e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 SNUPN-210ENST00000568162 759 ntTSL 317.73■□□□□ 0.432e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 SNUPN-211ENST00000569817 1023 ntTSL 317.27■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 SNUPN-203ENST00000563875 406 ntTSL 312.47□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 SNUPN-202ENST00000563793 661 ntTSL 411.42□□□□□ -0.582e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 SNUPN-204ENST00000564086 644 ntTSL 29.12□□□□□ -0.952e-10■■■■■ 64.2
GTF2F1P35269 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.022e-9■■■■■ 64.1
GTF2F1P35269 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.494e-8■■■■■ 64
GTF2F1P35269 MAPK3-207ENST00000466521 1878 ntTSL 533.63■■■□□ 2.971e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.971e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.731e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MAPK3-214ENST00000490298 1718 ntTSL 528.94■■■□□ 2.221e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.061e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.881e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MAPK3-211ENST00000483869 738 ntTSL 311.68□□□□□ -0.541e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MAPK3-210ENST00000481230 465 ntTSL 510.26□□□□□ -0.771e-14■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 MED22-210ENST00000614493 3886 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.36e-18■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.318e-25■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)21.92■■□□□ 1.18e-25■■■■■ 63.9
GTF2F1P35269 NCAPG2-210ENST00000491792 581 ntTSL 313.41□□□□□ -0.262e-37■■■■■ 63.7
GTF2F1P35269 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 63.6
GTF2F1P35269 PLOD1-209ENST00000491536 639 ntTSL 311.37□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 63.6
GTF2F1P35269 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.151e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.11e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-223ENST00000591736 573 ntTSL 420.37■□□□□ 0.851e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-215ENST00000588879 535 ntTSL 520.37■□□□□ 0.851e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-210ENST00000587463 461 ntTSL 520.37■□□□□ 0.851e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-227ENST00000592266 589 ntTSL 419.35■□□□□ 0.691e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-224ENST00000591881 575 ntTSL 519.35■□□□□ 0.691e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.481e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-222ENST00000591333 557 ntTSL 417.97■□□□□ 0.471e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-211ENST00000587479 547 ntTSL 417.55■□□□□ 0.41e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.391e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-208ENST00000587263 579 ntTSL 517.15■□□□□ 0.341e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-221ENST00000591124 575 ntTSL 417.02■□□□□ 0.321e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-229ENST00000592771 1937 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.261e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-217ENST00000589886 472 ntTSL 416.5■□□□□ 0.231e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.21e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-213ENST00000587956 512 ntTSL 515.76■□□□□ 0.111e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.061e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-225ENST00000592133 562 ntTSL 414.31□□□□□ -0.121e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.261e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-202ENST00000340578 3233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-228ENST00000592621 818 ntTSL 512.64□□□□□ -0.391e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-205ENST00000586117 524 ntTSL 412.47□□□□□ -0.411e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.441e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-207ENST00000587159 554 ntTSL 511.99□□□□□ -0.491e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.521e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-219ENST00000590953 571 ntTSL 310.6□□□□□ -0.711e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-216ENST00000589353 490 ntTSL 510.59□□□□□ -0.711e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 PGBD2-203ENST00000462488 282 ntTSL 59.15□□□□□ -0.941e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-204ENST00000585339 566 ntTSL 48.88□□□□□ -0.991e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 28.86□□□□□ -0.991e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 28.63□□□□□ -1.031e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-218ENST00000590623 786 ntTSL 58.41□□□□□ -1.061e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.161e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.311e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.391e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 RANBP3-214ENST00000588010 568 ntTSL 55.68□□□□□ -1.51e-15■■■■■ 63.3
GTF2F1P35269 CPSF7-207ENST00000449811 567 ntTSL 415.96■□□□□ 0.152e-10■■■■■ 63.2
GTF2F1P35269 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)24.88■■□□□ 1.574e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.334e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.174e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 221.94■■□□□ 1.14e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-212ENST00000580492 553 ntTSL 521.92■■□□□ 1.14e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.094e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 521.88■■□□□ 1.094e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 221.78■■□□□ 1.084e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 221.75■■□□□ 1.074e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 14e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 14e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.974e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.884e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-207ENST00000577932 572 ntTSL 220.26■□□□□ 0.834e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-210ENST00000579543 558 ntTSL 419.81■□□□□ 0.764e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 FDXR-213ENST00000581219 567 ntTSL 418.47■□□□□ 0.554e-11■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.255e-8■■■■■ 62.5
GTF2F1P35269 TNK2-214ENST00000464041 3545 ntTSL 1 (best)16.51■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 62.5
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 340.8 ms