Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HOXA7P31268 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXA7P31268 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HOXA7P31268 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HOXA7P31268 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HOXA7P31268 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HOXA7P31268 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXA7P31268 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms