Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNGA1P29973 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNGA1P29973 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGA1P29973 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNGA1P29973 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CNGA1P29973 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGA1P29973 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNGA1P29973 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGA1P29973 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGA1P29973 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGA1P29973 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGA1P29973 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGA1P29973 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGA1P29973 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGA1P29973 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms