Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB2P29323 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB2P29323 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB2P29323 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB2P29323 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB2P29323 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB2P29323 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB2P29323 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB2P29323 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB2P29323 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB2P29323 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB2P29323 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB2P29323 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB2P29323 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB2P29323 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB2P29323 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB2P29323 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB2P29323 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB2P29323 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB2P29323 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB2P29323 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB2P29323 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms