Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFYAP23511 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFYAP23511 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFYAP23511 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFYAP23511 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFYAP23511 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFYAP23511 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFYAP23511 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFYAP23511 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFYAP23511 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFYAP23511 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFYAP23511 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFYAP23511 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFYAP23511 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFYAP23511 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFYAP23511 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFYAP23511 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFYAP23511 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFYAP23511 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFYAP23511 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFYAP23511 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFYAP23511 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFYAP23511 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFYAP23511 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFYAP23511 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFYAP23511 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFYAP23511 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFYAP23511 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFYAP23511 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFYAP23511 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFYAP23511 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFYAP23511 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFYAP23511 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFYAP23511 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFYAP23511 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFYAP23511 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFYAP23511 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFYAP23511 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFYAP23511 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFYAP23511 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFYAP23511 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFYAP23511 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFYAP23511 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFYAP23511 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFYAP23511 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFYAP23511 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFYAP23511 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFYAP23511 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFYAP23511 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFYAP23511 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFYAP23511 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFYAP23511 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFYAP23511 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFYAP23511 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFYAP23511 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFYAP23511 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFYAP23511 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFYAP23511 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFYAP23511 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFYAP23511 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFYAP23511 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFYAP23511 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFYAP23511 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFYAP23511 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFYAP23511 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFYAP23511 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFYAP23511 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFYAP23511 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFYAP23511 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFYAP23511 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFYAP23511 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFYAP23511 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFYAP23511 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFYAP23511 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFYAP23511 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFYAP23511 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFYAP23511 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFYAP23511 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFYAP23511 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFYAP23511 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFYAP23511 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFYAP23511 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFYAP23511 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFYAP23511 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFYAP23511 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFYAP23511 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFYAP23511 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFYAP23511 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFYAP23511 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFYAP23511 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFYAP23511 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFYAP23511 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFYAP23511 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFYAP23511 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFYAP23511 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFYAP23511 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFYAP23511 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFYAP23511 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFYAP23511 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFYAP23511 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms