Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF4P23510 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF4P23510 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF4P23510 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF4P23510 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF4P23510 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms