Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTPS1P17812 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTPS1P17812 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTPS1P17812 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTPS1P17812 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTPS1P17812 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms