Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7P17544 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7P17544 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7P17544 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF7P17544 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF7P17544 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF7P17544 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7P17544 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7P17544 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7P17544 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF7P17544 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF7P17544 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF7P17544 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF7P17544 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF7P17544 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7P17544 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7P17544 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7P17544 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7P17544 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF7P17544 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7P17544 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7P17544 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7P17544 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7P17544 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7P17544 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7P17544 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7P17544 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7P17544 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7P17544 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7P17544 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7P17544 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7P17544 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7P17544 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7P17544 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF7P17544 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF7P17544 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF7P17544 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF7P17544 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF7P17544 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7P17544 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF7P17544 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7P17544 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF7P17544 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7P17544 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7P17544 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7P17544 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7P17544 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7P17544 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7P17544 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7P17544 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF7P17544 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF7P17544 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7P17544 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7P17544 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7P17544 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7P17544 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7P17544 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF7P17544 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7P17544 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7P17544 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7P17544 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF7P17544 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7P17544 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7P17544 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7P17544 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF7P17544 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7P17544 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7P17544 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7P17544 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF7P17544 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF7P17544 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7P17544 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF7P17544 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7P17544 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7P17544 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7P17544 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF7P17544 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7P17544 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7P17544 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7P17544 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF7P17544 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF7P17544 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7P17544 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7P17544 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF7P17544 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF7P17544 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF7P17544 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF7P17544 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF7P17544 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF7P17544 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7P17544 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF7P17544 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF7P17544 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF7P17544 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF7P17544 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF7P17544 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7P17544 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7P17544 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7P17544 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF7P17544 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms