Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB4P17483 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB4P17483 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB4P17483 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB4P17483 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB4P17483 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB4P17483 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms