Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI4P10075 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI4P10075 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI4P10075 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLI4P10075 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GLI4P10075 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI4P10075 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI4P10075 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI4P10075 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI4P10075 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI4P10075 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI4P10075 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI4P10075 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI4P10075 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLI4P10075 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI4P10075 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI4P10075 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI4P10075 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI4P10075 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI4P10075 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI4P10075 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI4P10075 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLI4P10075 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI4P10075 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI4P10075 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLI4P10075 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI4P10075 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI4P10075 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI4P10075 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI4P10075 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI4P10075 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI4P10075 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI4P10075 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI4P10075 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI4P10075 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI4P10075 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI4P10075 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI4P10075 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI4P10075 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI4P10075 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI4P10075 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI4P10075 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI4P10075 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI4P10075 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI4P10075 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI4P10075 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI4P10075 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI4P10075 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI4P10075 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI4P10075 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI4P10075 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI4P10075 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI4P10075 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI4P10075 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI4P10075 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI4P10075 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI4P10075 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI4P10075 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI4P10075 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI4P10075 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI4P10075 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI4P10075 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI4P10075 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI4P10075 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI4P10075 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI4P10075 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI4P10075 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI4P10075 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI4P10075 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI4P10075 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI4P10075 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI4P10075 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI4P10075 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI4P10075 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI4P10075 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI4P10075 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI4P10075 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI4P10075 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI4P10075 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI4P10075 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI4P10075 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI4P10075 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI4P10075 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI4P10075 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI4P10075 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI4P10075 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI4P10075 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI4P10075 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI4P10075 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI4P10075 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI4P10075 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI4P10075 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms