Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKR1P10072 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKR1P10072 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKR1P10072 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKR1P10072 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HKR1P10072 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKR1P10072 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKR1P10072 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HKR1P10072 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKR1P10072 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HKR1P10072 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HKR1P10072 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKR1P10072 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKR1P10072 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HKR1P10072 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKR1P10072 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKR1P10072 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKR1P10072 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKR1P10072 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HKR1P10072 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HKR1P10072 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HKR1P10072 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HKR1P10072 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKR1P10072 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKR1P10072 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HKR1P10072 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKR1P10072 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HKR1P10072 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HKR1P10072 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HKR1P10072 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HKR1P10072 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HKR1P10072 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKR1P10072 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKR1P10072 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HKR1P10072 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HKR1P10072 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKR1P10072 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKR1P10072 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKR1P10072 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKR1P10072 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKR1P10072 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKR1P10072 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKR1P10072 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKR1P10072 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKR1P10072 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKR1P10072 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKR1P10072 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKR1P10072 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HKR1P10072 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HKR1P10072 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HKR1P10072 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKR1P10072 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKR1P10072 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKR1P10072 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKR1P10072 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKR1P10072 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKR1P10072 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKR1P10072 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKR1P10072 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKR1P10072 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKR1P10072 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKR1P10072 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKR1P10072 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKR1P10072 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HKR1P10072 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKR1P10072 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKR1P10072 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKR1P10072 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKR1P10072 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKR1P10072 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKR1P10072 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKR1P10072 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HKR1P10072 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HKR1P10072 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HKR1P10072 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HKR1P10072 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HKR1P10072 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HKR1P10072 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HKR1P10072 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HKR1P10072 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HKR1P10072 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HKR1P10072 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HKR1P10072 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HKR1P10072 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HKR1P10072 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HKR1P10072 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HKR1P10072 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HKR1P10072 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HKR1P10072 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HKR1P10072 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HKR1P10072 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HKR1P10072 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms