Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CALM3P0DP25 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CALM3P0DP25 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CALM3P0DP25 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CALM3P0DP25 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CALM3P0DP25 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CALM3P0DP25 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALM3P0DP25 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CALM3P0DP25 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALM3P0DP25 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CALM3P0DP25 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CALM3P0DP25 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CALM3P0DP25 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CALM3P0DP25 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CALM3P0DP25 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms