Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV3-33P01772 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-33P01772 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV3-33P01772 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHV3-33P01772 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGHV3-33P01772 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-33P01772 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms