Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NSD2O96028 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NSD2O96028 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NSD2O96028 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NSD2O96028 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NSD2O96028 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NSD2O96028 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NSD2O96028 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NSD2O96028 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NSD2O96028 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NSD2O96028 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NSD2O96028 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NSD2O96028 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NSD2O96028 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NSD2O96028 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NSD2O96028 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NSD2O96028 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NSD2O96028 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NSD2O96028 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NSD2O96028 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NSD2O96028 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NSD2O96028 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NSD2O96028 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NSD2O96028 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NSD2O96028 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NSD2O96028 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NSD2O96028 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NSD2O96028 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NSD2O96028 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NSD2O96028 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NSD2O96028 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NSD2O96028 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NSD2O96028 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NSD2O96028 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NSD2O96028 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NSD2O96028 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NSD2O96028 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NSD2O96028 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD2O96028 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD2O96028 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD2O96028 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NSD2O96028 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NSD2O96028 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NSD2O96028 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NSD2O96028 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NSD2O96028 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NSD2O96028 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NSD2O96028 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NSD2O96028 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NSD2O96028 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NSD2O96028 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NSD2O96028 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NSD2O96028 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NSD2O96028 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NSD2O96028 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NSD2O96028 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NSD2O96028 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NSD2O96028 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NSD2O96028 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NSD2O96028 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NSD2O96028 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NSD2O96028 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NSD2O96028 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NSD2O96028 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NSD2O96028 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NSD2O96028 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NSD2O96028 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NSD2O96028 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NSD2O96028 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NSD2O96028 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NSD2O96028 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NSD2O96028 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NSD2O96028 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NSD2O96028 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NSD2O96028 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NSD2O96028 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NSD2O96028 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NSD2O96028 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NSD2O96028 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NSD2O96028 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NSD2O96028 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NSD2O96028 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NSD2O96028 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NSD2O96028 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NSD2O96028 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NSD2O96028 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NSD2O96028 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NSD2O96028 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NSD2O96028 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NSD2O96028 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NSD2O96028 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NSD2O96028 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NSD2O96028 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NSD2O96028 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NSD2O96028 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NSD2O96028 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NSD2O96028 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NSD2O96028 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NSD2O96028 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NSD2O96028 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms