Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFT2D2O95562 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFT2D2O95562 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFT2D2O95562 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D2O95562 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SFT2D2O95562 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms