Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPINO95295 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPINO95295 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPINO95295 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPINO95295 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAPINO95295 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPINO95295 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPINO95295 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPINO95295 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPINO95295 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPINO95295 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPINO95295 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPINO95295 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPINO95295 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNAPINO95295 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPINO95295 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPINO95295 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPINO95295 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPINO95295 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPINO95295 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPINO95295 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPINO95295 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPINO95295 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPINO95295 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPINO95295 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPINO95295 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms