Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNDBP1O95273 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNDBP1O95273 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1O95273 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNDBP1O95273 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1O95273 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNDBP1O95273 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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