Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP4O75096 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP4O75096 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP4O75096 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP4O75096 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRP4O75096 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRP4O75096 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRP4O75096 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRP4O75096 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRP4O75096 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRP4O75096 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRP4O75096 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRP4O75096 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRP4O75096 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRP4O75096 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRP4O75096 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRP4O75096 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRP4O75096 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRP4O75096 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRP4O75096 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRP4O75096 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRP4O75096 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRP4O75096 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRP4O75096 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRP4O75096 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRP4O75096 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRP4O75096 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRP4O75096 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRP4O75096 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRP4O75096 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRP4O75096 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRP4O75096 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRP4O75096 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRP4O75096 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRP4O75096 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRP4O75096 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRP4O75096 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LRP4O75096 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRP4O75096 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRP4O75096 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRP4O75096 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRP4O75096 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRP4O75096 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRP4O75096 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRP4O75096 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRP4O75096 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRP4O75096 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRP4O75096 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRP4O75096 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRP4O75096 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRP4O75096 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRP4O75096 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRP4O75096 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRP4O75096 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRP4O75096 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRP4O75096 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRP4O75096 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRP4O75096 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRP4O75096 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRP4O75096 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRP4O75096 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRP4O75096 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRP4O75096 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRP4O75096 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRP4O75096 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRP4O75096 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRP4O75096 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRP4O75096 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRP4O75096 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRP4O75096 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRP4O75096 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRP4O75096 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRP4O75096 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRP4O75096 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRP4O75096 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRP4O75096 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRP4O75096 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRP4O75096 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRP4O75096 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRP4O75096 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRP4O75096 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
LRP4O75096 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRP4O75096 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRP4O75096 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRP4O75096 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRP4O75096 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRP4O75096 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRP4O75096 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRP4O75096 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRP4O75096 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRP4O75096 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRP4O75096 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRP4O75096 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRP4O75096 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRP4O75096 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRP4O75096 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRP4O75096 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRP4O75096 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRP4O75096 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRP4O75096 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms