Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKNO60260 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKNO60260 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKNO60260 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKNO60260 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKNO60260 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKNO60260 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKNO60260 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKNO60260 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKNO60260 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKNO60260 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKNO60260 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKNO60260 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKNO60260 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKNO60260 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKNO60260 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKNO60260 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKNO60260 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKNO60260 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKNO60260 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKNO60260 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKNO60260 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKNO60260 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKNO60260 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKNO60260 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKNO60260 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKNO60260 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKNO60260 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKNO60260 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKNO60260 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKNO60260 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKNO60260 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKNO60260 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKNO60260 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKNO60260 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKNO60260 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKNO60260 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKNO60260 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKNO60260 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKNO60260 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKNO60260 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKNO60260 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKNO60260 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKNO60260 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKNO60260 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKNO60260 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKNO60260 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKNO60260 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKNO60260 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKNO60260 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKNO60260 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKNO60260 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKNO60260 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKNO60260 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKNO60260 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKNO60260 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKNO60260 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKNO60260 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKNO60260 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKNO60260 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKNO60260 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKNO60260 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKNO60260 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKNO60260 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKNO60260 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKNO60260 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKNO60260 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKNO60260 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKNO60260 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKNO60260 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKNO60260 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKNO60260 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKNO60260 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKNO60260 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKNO60260 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKNO60260 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKNO60260 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKNO60260 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKNO60260 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKNO60260 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKNO60260 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKNO60260 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKNO60260 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKNO60260 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKNO60260 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKNO60260 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKNO60260 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKNO60260 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKNO60260 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKNO60260 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKNO60260 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKNO60260 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKNO60260 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKNO60260 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKNO60260 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKNO60260 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKNO60260 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKNO60260 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKNO60260 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKNO60260 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms