Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX1O43933 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX1O43933 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX1O43933 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX1O43933 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX1O43933 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX1O43933 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX1O43933 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX1O43933 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX1O43933 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX1O43933 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX1O43933 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX1O43933 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX1O43933 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX1O43933 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PEX1O43933 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX1O43933 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX1O43933 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX1O43933 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX1O43933 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX1O43933 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX1O43933 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX1O43933 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX1O43933 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX1O43933 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX1O43933 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX1O43933 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX1O43933 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX1O43933 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PEX1O43933 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PEX1O43933 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX1O43933 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX1O43933 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX1O43933 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX1O43933 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX1O43933 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX1O43933 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX1O43933 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX1O43933 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX1O43933 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX1O43933 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX1O43933 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX1O43933 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX1O43933 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX1O43933 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX1O43933 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX1O43933 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX1O43933 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX1O43933 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX1O43933 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX1O43933 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX1O43933 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX1O43933 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX1O43933 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX1O43933 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX1O43933 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX1O43933 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX1O43933 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX1O43933 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX1O43933 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX1O43933 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX1O43933 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX1O43933 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX1O43933 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX1O43933 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX1O43933 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX1O43933 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX1O43933 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX1O43933 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX1O43933 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX1O43933 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX1O43933 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX1O43933 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX1O43933 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX1O43933 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX1O43933 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX1O43933 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX1O43933 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX1O43933 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX1O43933 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX1O43933 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX1O43933 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX1O43933 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX1O43933 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX1O43933 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX1O43933 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX1O43933 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX1O43933 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX1O43933 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX1O43933 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX1O43933 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX1O43933 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX1O43933 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX1O43933 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX1O43933 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX1O43933 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX1O43933 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX1O43933 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX1O43933 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX1O43933 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms