Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IDH3BO43837 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IDH3BO43837 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IDH3BO43837 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IDH3BO43837 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDH3BO43837 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDH3BO43837 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms