Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HCRTO43612 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HCRTO43612 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HCRTO43612 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HCRTO43612 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HCRTO43612 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HCRTO43612 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HCRTO43612 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HCRTO43612 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HCRTO43612 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HCRTO43612 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HCRTO43612 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HCRTO43612 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCRTO43612 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCRTO43612 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCRTO43612 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HCRTO43612 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HCRTO43612 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HCRTO43612 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HCRTO43612 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HCRTO43612 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HCRTO43612 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HCRTO43612 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HCRTO43612 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HCRTO43612 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HCRTO43612 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HCRTO43612 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HCRTO43612 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HCRTO43612 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HCRTO43612 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HCRTO43612 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HCRTO43612 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HCRTO43612 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HCRTO43612 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HCRTO43612 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HCRTO43612 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HCRTO43612 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HCRTO43612 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HCRTO43612 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HCRTO43612 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HCRTO43612 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HCRTO43612 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCRTO43612 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCRTO43612 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HCRTO43612 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HCRTO43612 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HCRTO43612 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HCRTO43612 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HCRTO43612 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HCRTO43612 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HCRTO43612 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HCRTO43612 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HCRTO43612 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HCRTO43612 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HCRTO43612 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HCRTO43612 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HCRTO43612 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HCRTO43612 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HCRTO43612 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HCRTO43612 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HCRTO43612 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HCRTO43612 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HCRTO43612 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HCRTO43612 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HCRTO43612 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCRTO43612 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCRTO43612 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCRTO43612 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCRTO43612 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCRTO43612 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCRTO43612 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCRTO43612 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCRTO43612 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCRTO43612 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HCRTO43612 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCRTO43612 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCRTO43612 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCRTO43612 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCRTO43612 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCRTO43612 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCRTO43612 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCRTO43612 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCRTO43612 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCRTO43612 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCRTO43612 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCRTO43612 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HCRTO43612 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HCRTO43612 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HCRTO43612 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HCRTO43612 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HCRTO43612 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HCRTO43612 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCRTO43612 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCRTO43612 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCRTO43612 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCRTO43612 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCRTO43612 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCRTO43612 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCRTO43612 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCRTO43612 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms