Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF208O43345 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF208O43345 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF208O43345 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF208O43345 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF208O43345 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF208O43345 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms