Protein–RNA interactions for Protein: O43169

CYB5B, Cytochrome b5 type B, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB5BO43169 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYB5BO43169 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYB5BO43169 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYB5BO43169 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYB5BO43169 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYB5BO43169 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYB5BO43169 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYB5BO43169 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYB5BO43169 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYB5BO43169 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYB5BO43169 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYB5BO43169 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYB5BO43169 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYB5BO43169 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYB5BO43169 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYB5BO43169 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYB5BO43169 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYB5BO43169 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYB5BO43169 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYB5BO43169 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYB5BO43169 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYB5BO43169 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYB5BO43169 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYB5BO43169 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYB5BO43169 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYB5BO43169 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYB5BO43169 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYB5BO43169 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYB5BO43169 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYB5BO43169 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYB5BO43169 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYB5BO43169 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms