Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IPO8O15397 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IPO8O15397 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IPO8O15397 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
IPO8O15397 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IPO8O15397 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IPO8O15397 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IPO8O15397 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IPO8O15397 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IPO8O15397 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IPO8O15397 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IPO8O15397 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
IPO8O15397 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IPO8O15397 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
IPO8O15397 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IPO8O15397 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IPO8O15397 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IPO8O15397 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
IPO8O15397 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IPO8O15397 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
IPO8O15397 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IPO8O15397 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IPO8O15397 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IPO8O15397 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IPO8O15397 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IPO8O15397 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
IPO8O15397 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
IPO8O15397 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
IPO8O15397 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
IPO8O15397 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
IPO8O15397 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IPO8O15397 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
IPO8O15397 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
IPO8O15397 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
IPO8O15397 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
IPO8O15397 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IPO8O15397 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IPO8O15397 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IPO8O15397 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IPO8O15397 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IPO8O15397 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IPO8O15397 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IPO8O15397 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IPO8O15397 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
IPO8O15397 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
IPO8O15397 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
IPO8O15397 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.79■■■■□ 3
IPO8O15397 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
IPO8O15397 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
IPO8O15397 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
IPO8O15397 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
IPO8O15397 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
IPO8O15397 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IPO8O15397 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IPO8O15397 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IPO8O15397 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IPO8O15397 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
IPO8O15397 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IPO8O15397 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
IPO8O15397 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
IPO8O15397 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
IPO8O15397 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
IPO8O15397 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IPO8O15397 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
IPO8O15397 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
IPO8O15397 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IPO8O15397 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IPO8O15397 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IPO8O15397 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IPO8O15397 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IPO8O15397 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IPO8O15397 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IPO8O15397 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IPO8O15397 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
IPO8O15397 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IPO8O15397 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IPO8O15397 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IPO8O15397 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
IPO8O15397 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IPO8O15397 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IPO8O15397 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IPO8O15397 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IPO8O15397 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IPO8O15397 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IPO8O15397 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IPO8O15397 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IPO8O15397 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IPO8O15397 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IPO8O15397 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IPO8O15397 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IPO8O15397 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IPO8O15397 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
IPO8O15397 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
IPO8O15397 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IPO8O15397 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IPO8O15397 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
IPO8O15397 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IPO8O15397 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IPO8O15397 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IPO8O15397 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms