Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
FANCAO15360 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
FANCAO15360 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.66■■■■■ 4.26
FANCAO15360 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
FANCAO15360 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
FANCAO15360 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.63■■■■■ 4.25
FANCAO15360 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
FANCAO15360 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
FANCAO15360 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
FANCAO15360 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
FANCAO15360 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
FANCAO15360 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
FANCAO15360 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
FANCAO15360 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.54■■■■■ 4.24
FANCAO15360 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
FANCAO15360 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
FANCAO15360 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
FANCAO15360 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
FANCAO15360 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
FANCAO15360 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
FANCAO15360 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
FANCAO15360 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCAO15360 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCAO15360 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCAO15360 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCAO15360 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCAO15360 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCAO15360 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCAO15360 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
FANCAO15360 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
FANCAO15360 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
FANCAO15360 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
FANCAO15360 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
FANCAO15360 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
FANCAO15360 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
FANCAO15360 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
FANCAO15360 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
FANCAO15360 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
FANCAO15360 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
FANCAO15360 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
FANCAO15360 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
FANCAO15360 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
FANCAO15360 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
FANCAO15360 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
FANCAO15360 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
FANCAO15360 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
FANCAO15360 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
FANCAO15360 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
FANCAO15360 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
FANCAO15360 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
FANCAO15360 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
FANCAO15360 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
FANCAO15360 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
FANCAO15360 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
FANCAO15360 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
FANCAO15360 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
FANCAO15360 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
FANCAO15360 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
FANCAO15360 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
FANCAO15360 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
FANCAO15360 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
FANCAO15360 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
FANCAO15360 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
FANCAO15360 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
FANCAO15360 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
FANCAO15360 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
FANCAO15360 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
FANCAO15360 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
FANCAO15360 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
FANCAO15360 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
FANCAO15360 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCAO15360 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCAO15360 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCAO15360 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCAO15360 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
FANCAO15360 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCAO15360 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCAO15360 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCAO15360 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCAO15360 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
FANCAO15360 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
FANCAO15360 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
FANCAO15360 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
FANCAO15360 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FANCAO15360 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
FANCAO15360 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FANCAO15360 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
FANCAO15360 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
FANCAO15360 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
FANCAO15360 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms