Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VILLO15195 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VILLO15195 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VILLO15195 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VILLO15195 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VILLO15195 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VILLO15195 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VILLO15195 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VILLO15195 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VILLO15195 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VILLO15195 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VILLO15195 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VILLO15195 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VILLO15195 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VILLO15195 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VILLO15195 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VILLO15195 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VILLO15195 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VILLO15195 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VILLO15195 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VILLO15195 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VILLO15195 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VILLO15195 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VILLO15195 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VILLO15195 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VILLO15195 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VILLO15195 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VILLO15195 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VILLO15195 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VILLO15195 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VILLO15195 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VILLO15195 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VILLO15195 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VILLO15195 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VILLO15195 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VILLO15195 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VILLO15195 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VILLO15195 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VILLO15195 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VILLO15195 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VILLO15195 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VILLO15195 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VILLO15195 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VILLO15195 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VILLO15195 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VILLO15195 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VILLO15195 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VILLO15195 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VILLO15195 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VILLO15195 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VILLO15195 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VILLO15195 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VILLO15195 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VILLO15195 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VILLO15195 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VILLO15195 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VILLO15195 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VILLO15195 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VILLO15195 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VILLO15195 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VILLO15195 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VILLO15195 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VILLO15195 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VILLO15195 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VILLO15195 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms