Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
APAF1O14727 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
APAF1O14727 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
APAF1O14727 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
APAF1O14727 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
APAF1O14727 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
APAF1O14727 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
APAF1O14727 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
APAF1O14727 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
APAF1O14727 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
APAF1O14727 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
APAF1O14727 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
APAF1O14727 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
APAF1O14727 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
APAF1O14727 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
APAF1O14727 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
APAF1O14727 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
APAF1O14727 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
APAF1O14727 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
APAF1O14727 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
APAF1O14727 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
APAF1O14727 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
APAF1O14727 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
APAF1O14727 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
APAF1O14727 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
APAF1O14727 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
APAF1O14727 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
APAF1O14727 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
APAF1O14727 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
APAF1O14727 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
APAF1O14727 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
APAF1O14727 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
APAF1O14727 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
APAF1O14727 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
APAF1O14727 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APAF1O14727 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APAF1O14727 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APAF1O14727 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APAF1O14727 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
APAF1O14727 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
APAF1O14727 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
APAF1O14727 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
APAF1O14727 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
APAF1O14727 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
APAF1O14727 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
APAF1O14727 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
APAF1O14727 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
APAF1O14727 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
APAF1O14727 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
APAF1O14727 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
APAF1O14727 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
APAF1O14727 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
APAF1O14727 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
APAF1O14727 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
APAF1O14727 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
APAF1O14727 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
APAF1O14727 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
APAF1O14727 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
APAF1O14727 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
APAF1O14727 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
APAF1O14727 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
APAF1O14727 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
APAF1O14727 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
APAF1O14727 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
APAF1O14727 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
APAF1O14727 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
APAF1O14727 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
APAF1O14727 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
APAF1O14727 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
APAF1O14727 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
APAF1O14727 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
APAF1O14727 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35■■■■□ 3.19
APAF1O14727 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
APAF1O14727 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
APAF1O14727 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
APAF1O14727 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
APAF1O14727 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
APAF1O14727 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
APAF1O14727 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
APAF1O14727 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
APAF1O14727 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
APAF1O14727 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
APAF1O14727 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
APAF1O14727 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
APAF1O14727 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
APAF1O14727 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
APAF1O14727 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
APAF1O14727 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
APAF1O14727 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
APAF1O14727 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
APAF1O14727 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
APAF1O14727 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
APAF1O14727 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
APAF1O14727 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
APAF1O14727 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
APAF1O14727 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
APAF1O14727 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
APAF1O14727 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
APAF1O14727 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
APAF1O14727 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms