Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PGRMC1O00264 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PGRMC1O00264 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PGRMC1O00264 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGRMC1O00264 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGRMC1O00264 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PGRMC1O00264 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGRMC1O00264 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGRMC1O00264 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGRMC1O00264 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGRMC1O00264 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PGRMC1O00264 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGRMC1O00264 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGRMC1O00264 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PGRMC1O00264 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGRMC1O00264 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PGRMC1O00264 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PGRMC1O00264 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PGRMC1O00264 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGRMC1O00264 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PGRMC1O00264 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PGRMC1O00264 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PGRMC1O00264 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms