Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYNX1G3V0Z9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNX1G3V0Z9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNX1G3V0Z9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNX1G3V0Z9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYNX1G3V0Z9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms