Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
F8VP50 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
F8VP50 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
F8VP50 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
F8VP50 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F8VP50 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F8VP50 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F8VP50 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F8VP50 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
F8VP50 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F8VP50 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F8VP50 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F8VP50 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F8VP50 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F8VP50 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
F8VP50 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
F8VP50 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
F8VP50 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
F8VP50 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
F8VP50 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
F8VP50 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
F8VP50 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
F8VP50 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
F8VP50 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
F8VP50 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
F8VP50 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
F8VP50 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8VP50 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8VP50 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8VP50 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8VP50 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
F8VP50 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
F8VP50 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
F8VP50 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
F8VP50 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
F8VP50 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
F8VP50 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
F8VP50 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
F8VP50 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
F8VP50 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
F8VP50 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
F8VP50 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
F8VP50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
F8VP50 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
F8VP50 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
F8VP50 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
F8VP50 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
F8VP50 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
F8VP50 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
F8VP50 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
F8VP50 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
F8VP50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
F8VP50 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
F8VP50 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
F8VP50 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
F8VP50 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
F8VP50 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
F8VP50 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
F8VP50 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
F8VP50 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
F8VP50 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
F8VP50 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
F8VP50 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
F8VP50 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
F8VP50 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
F8VP50 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F8VP50 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
F8VP50 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
F8VP50 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
F8VP50 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
F8VP50 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
F8VP50 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
F8VP50 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
F8VP50 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
F8VP50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
F8VP50 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F8VP50 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F8VP50 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F8VP50 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
F8VP50 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F8VP50 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F8VP50 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
F8VP50 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
F8VP50 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
F8VP50 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F8VP50 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8VP50 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8VP50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8VP50 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8VP50 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8VP50 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8VP50 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8VP50 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
F8VP50 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
F8VP50 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
F8VP50 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8VP50 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8VP50 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8VP50 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8VP50 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms