Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
E9PCH4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
E9PCH4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
E9PCH4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
E9PCH4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
E9PCH4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
E9PCH4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
E9PCH4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
E9PCH4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
E9PCH4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
E9PCH4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
E9PCH4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
E9PCH4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
E9PCH4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
E9PCH4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
E9PCH4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
E9PCH4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
E9PCH4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
E9PCH4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
E9PCH4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
E9PCH4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
E9PCH4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
E9PCH4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
E9PCH4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
E9PCH4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
E9PCH4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
E9PCH4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
E9PCH4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
E9PCH4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
E9PCH4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
E9PCH4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
E9PCH4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
E9PCH4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.36■■■■□ 3.89
E9PCH4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
E9PCH4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
E9PCH4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
E9PCH4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
E9PCH4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
E9PCH4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
E9PCH4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
E9PCH4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
E9PCH4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
E9PCH4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
E9PCH4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
E9PCH4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
E9PCH4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
E9PCH4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
E9PCH4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
E9PCH4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
E9PCH4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
E9PCH4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
E9PCH4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
E9PCH4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
E9PCH4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
E9PCH4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
E9PCH4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
E9PCH4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
E9PCH4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
E9PCH4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
E9PCH4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
E9PCH4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
E9PCH4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
E9PCH4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
E9PCH4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
E9PCH4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
E9PCH4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
E9PCH4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
E9PCH4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
E9PCH4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
E9PCH4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
E9PCH4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
E9PCH4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
E9PCH4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
E9PCH4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
E9PCH4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
E9PCH4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
E9PCH4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
E9PCH4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
E9PCH4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
E9PCH4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
E9PCH4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
E9PCH4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.04■■■■□ 3.84
E9PCH4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
E9PCH4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
E9PCH4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
E9PCH4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
E9PCH4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
E9PCH4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
E9PCH4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
E9PCH4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
E9PCH4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
E9PCH4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
E9PCH4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
E9PCH4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
E9PCH4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
E9PCH4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
E9PCH4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
E9PCH4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms