Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP2LA6PVI3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCBP2LA6PVI3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP2LA6PVI3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCBP2LA6PVI3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCBP2LA6PVI3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms