Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF233A6NK53 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF233A6NK53 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF233A6NK53 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF233A6NK53 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF233A6NK53 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF233A6NK53 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF233A6NK53 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF233A6NK53 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF233A6NK53 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms