Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3P1A6NDR6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3P1A6NDR6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P1A6NDR6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P1A6NDR6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3P1A6NDR6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms