Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNDIG1LA6NDD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNDIG1LA6NDD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1LA6NDD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNDIG1LA6NDD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNDIG1LA6NDD5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNDIG1LA6NDD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1433.1 ms