Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VWA3AA6NCI4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VWA3AA6NCI4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWA3AA6NCI4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VWA3AA6NCI4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VWA3AA6NCI4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWA3AA6NCI4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWA3AA6NCI4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWA3AA6NCI4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VWA3AA6NCI4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms