Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM221AA4D161 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM221AA4D161 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM221AA4D161 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM221AA4D161 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM221AA4D161 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms