Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP58Q9Y2X3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms