RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369124.4

PLEKHO1-201, Transcript of pleckstrin homology domain containing O1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHO1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHO1-201ENST00000369124 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.58■■■■■ 5.53
PLEKHO1-201ENST00000369124 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.22■■■■■ 4.51
PLEKHO1-201ENST00000369124 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
PLEKHO1-201ENST00000369124 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.13■■■■■ 4.17
PLEKHO1-201ENST00000369124 ABCC9O60706 1549 aa41.07■■■■■ 4.16
PLEKHO1-201ENST00000369124 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.96■■■■■ 4.15
PLEKHO1-201ENST00000369124 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.51■■■■■ 4.08
PLEKHO1-201ENST00000369124 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.48■■■■■ 4.07
PLEKHO1-201ENST00000369124 NACADO15069 1562 aa40.32■■■■■ 4.05
PLEKHO1-201ENST00000369124 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.01■■■■■ 4
PLEKHO1-201ENST00000369124 SCRIBQ14160 1630 aa39.81■■■■□ 3.96
PLEKHO1-201ENST00000369124 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.1■■■■□ 3.85
PLEKHO1-201ENST00000369124 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
PLEKHO1-201ENST00000369124 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.77■■■■□ 3.8
PLEKHO1-201ENST00000369124 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.74■■■■□ 3.79
PLEKHO1-201ENST00000369124 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.56■■■■□ 3.76
PLEKHO1-201ENST00000369124 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
PLEKHO1-201ENST00000369124 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.31■■■■□ 3.72
PLEKHO1-201ENST00000369124 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
PLEKHO1-201ENST00000369124 SMARCA4P51532 1647 aa38.12■■■■□ 3.69
PLEKHO1-201ENST00000369124 WIZO95785 1651 aa37.97■■■■□ 3.67
PLEKHO1-201ENST00000369124 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
PLEKHO1-201ENST00000369124 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.63■■■■□ 3.61
PLEKHO1-201ENST00000369124 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
PLEKHO1-201ENST00000369124 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.55■■■■□ 3.6
PLEKHO1-201ENST00000369124 SMARCA2P51531 1590 aa37.52■■■■□ 3.6
PLEKHO1-201ENST00000369124 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
PLEKHO1-201ENST00000369124 NCAPD3P42695 1498 aa37.23■■■■□ 3.55
PLEKHO1-201ENST00000369124 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.22■■■■□ 3.55
PLEKHO1-201ENST00000369124 HMGXB3Q12766 1538 aa37.15■■■■□ 3.54
PLEKHO1-201ENST00000369124 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.14■■■■□ 3.54
PLEKHO1-201ENST00000369124 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.11■■■■□ 3.53
PLEKHO1-201ENST00000369124 TRIM41Q8WV44 630 aa36.59■■■■□ 3.45
PLEKHO1-201ENST00000369124 ABCC8Q09428 1581 aa36.42■■■■□ 3.42
PLEKHO1-201ENST00000369124 CFTRP13569 1480 aa36.39■■■■□ 3.42
PLEKHO1-201ENST00000369124 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.3■■■■□ 3.4
PLEKHO1-201ENST00000369124 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.28■■■■□ 3.4
PLEKHO1-201ENST00000369124 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.39
PLEKHO1-201ENST00000369124 PRDM2Q13029 1718 aa36.09■■■■□ 3.37
PLEKHO1-201ENST00000369124 SYNJ1O43426 1573 aa36.03■■■■□ 3.36
PLEKHO1-201ENST00000369124 NESP48681 1621 aa36■■■■□ 3.35
PLEKHO1-201ENST00000369124 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.97■■■■□ 3.35
PLEKHO1-201ENST00000369124 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
PLEKHO1-201ENST00000369124 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.9■■■■□ 3.34
PLEKHO1-201ENST00000369124 TOP2BQ02880 1626 aa35.88■■■■□ 3.33
PLEKHO1-201ENST00000369124 CUX1P39880 1505 aa35.83■■■■□ 3.33
PLEKHO1-201ENST00000369124 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.82■■■■□ 3.32
PLEKHO1-201ENST00000369124 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.75■■■■□ 3.31
PLEKHO1-201ENST00000369124 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.75■■■■□ 3.31
PLEKHO1-201ENST00000369124 SOGA1O94964 1423 aa35.74■■■■□ 3.31
PLEKHO1-201ENST00000369124 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.69■■■■□ 3.3
PLEKHO1-201ENST00000369124 EEA1Q15075 1411 aa35.63■■■■□ 3.29
PLEKHO1-201ENST00000369124 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.59■■■■□ 3.29
PLEKHO1-201ENST00000369124 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.53■■■■□ 3.28
PLEKHO1-201ENST00000369124 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.51■■■■□ 3.28
PLEKHO1-201ENST00000369124 TOPBP1Q92547 1522 aa35.48■■■■□ 3.27
PLEKHO1-201ENST00000369124 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.48■■■■□ 3.27
PLEKHO1-201ENST00000369124 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.47■■■■□ 3.27
PLEKHO1-201ENST00000369124 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.47■■■■□ 3.27
PLEKHO1-201ENST00000369124 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
PLEKHO1-201ENST00000369124 KIF27Q86VH2 1401 aa35.32■■■■□ 3.24
PLEKHO1-201ENST00000369124 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
PLEKHO1-201ENST00000369124 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.27■■■■□ 3.24
PLEKHO1-201ENST00000369124 CUX2O14529 1486 aa35.25■■■■□ 3.23
PLEKHO1-201ENST00000369124 ERCC6Q03468 1493 aa35.25■■■■□ 3.23
PLEKHO1-201ENST00000369124 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.21■■■■□ 3.23
PLEKHO1-201ENST00000369124 GOLGA3Q08378 1498 aa35.15■■■■□ 3.22
PLEKHO1-201ENST00000369124 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.14■■■■□ 3.22
PLEKHO1-201ENST00000369124 KIF21BO75037 1637 aa35.14■■■■□ 3.22
PLEKHO1-201ENST00000369124 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
PLEKHO1-201ENST00000369124 WDR62O43379 1518 aa35.06■■■■□ 3.2
PLEKHO1-201ENST00000369124 PRXQ9BXM0 1461 aa35.02■■■■□ 3.2
PLEKHO1-201ENST00000369124 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.01■■■■□ 3.2
PLEKHO1-201ENST00000369124 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.01■■■■□ 3.19
PLEKHO1-201ENST00000369124 IGF1RP08069 1367 aa35■■■■□ 3.19
PLEKHO1-201ENST00000369124 WDR97A6NE52 1622 aa34.97■■■■□ 3.19
PLEKHO1-201ENST00000369124 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
PLEKHO1-201ENST00000369124 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.93■■■■□ 3.18
PLEKHO1-201ENST00000369124 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
PLEKHO1-201ENST00000369124 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
PLEKHO1-201ENST00000369124 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.84■■■■□ 3.17
PLEKHO1-201ENST00000369124 CEP162Q5TB80 1403 aa34.84■■■■□ 3.17
PLEKHO1-201ENST00000369124 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.83■■■■□ 3.17
PLEKHO1-201ENST00000369124 IFT140Q96RY7 1462 aa34.83■■■■□ 3.17
PLEKHO1-201ENST00000369124 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.82■■■■□ 3.16
PLEKHO1-201ENST00000369124 CUL7Q14999 1698 aa34.69■■■■□ 3.14
PLEKHO1-201ENST00000369124 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.68■■■■□ 3.14
PLEKHO1-201ENST00000369124 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
PLEKHO1-201ENST00000369124 CLIP1P30622 1438 aa34.6■■■■□ 3.13
PLEKHO1-201ENST00000369124 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
PLEKHO1-201ENST00000369124 GRIN2BQ13224 1484 aa34.56■■■■□ 3.12
PLEKHO1-201ENST00000369124 PBRM1Q86U86 1689 aa34.56■■■■□ 3.12
PLEKHO1-201ENST00000369124 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
PLEKHO1-201ENST00000369124 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.44■■■■□ 3.1
PLEKHO1-201ENST00000369124 ADAMTS12P58397 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
PLEKHO1-201ENST00000369124 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.35■■■■□ 3.09
PLEKHO1-201ENST00000369124 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.27■■■■□ 3.08
PLEKHO1-201ENST00000369124 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.27■■■■□ 3.08
PLEKHO1-201ENST00000369124 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
PLEKHO1-201ENST00000369124 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.25■■■■□ 3.07
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