Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT4

SRR, Serine racemase, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRQ9GZT4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRQ9GZT4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRQ9GZT4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRQ9GZT4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRQ9GZT4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRQ9GZT4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRRQ9GZT4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRQ9GZT4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms